创办时间不同：南京师范大学是在原南京大学、公立金陵大学等有关院系的基础上组建南京师范学院，1984年改办成南京师范大学。金陵女子学院成立于1987年。
院系不同：南京师范大学主要院系有文学院、数学科学学院、外国语学院、教育科学学院等。南京师范大学金陵女子学院是会计与财务管理系、劳动与社会保障系、食品科学与营养系、英语系、女性学系等。
材料补充：
1、南京师范大学（Nanjing Normal University），简称“南师”，是国家“世界一流学科建设高校”，国家“211工程”首批重点建设高校，江苏高水平大学建设高校；入选国家“111计划”、卓越教师培养计划、卓越法律人才教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、国家大学生文化素质教育基地，是中国高等师范教育的发祥地之一。
2、南京师范大学金陵女子学院（Nanjing Normal University Ginling College）是江苏省唯一的一所公办女子学院，是全国办学层次最高的女子学院，承担女子精英人才培养、妇女研究和对外交流多重任务。