沈阳农业大学的办学历史可追溯到我国农业教育的始兴时期—1906年清政府设立的省立奉天农业学堂，以后经历了奉天农业大学、东北大学农学院和沈阳农学院几个历史时期，1952年全国高等院校调整，与复旦大学农学院合并组建成了新的`沈阳农学院。1979年10月经国务院批准为全国重点高等院校
1981年被批准为首批具有博士、硕士学位授予权单位；1985年10月，更名为沈阳农业大学，邓小平同志亲自为学校题写了校名。2000年，学校由农业部所属划转为以辽宁省管理为主、辽宁省与中央共建的全国重点大学。
学校形成了比较完整的农业教育科研体系。现有6个博士后科研流动站，75个博士学位授予权专业，115个硕士学位授予权专业，57个本科专业；学校有3个国家重点学科，3个农业部重点学科，7个辽宁省高等学校一流特色学科，24个辽宁省重点学科。根据科睿唯安发布的最新ESI数据显示，我校农业科学持续进入全球ESI前1%学科。
学校设有16个学院、4个教学部（中心、所）；有包括国家工程实验室、国家地方联合工程实验室、科技部和教育部批准设立的新农村发展研究院在内的省级以上（含沈阳市）科学研究机构82个、基础实验室及实验教学中心19个。