一、by 与 with 表示方式的.区别：
by 表示抽象的方式和手段，with 表示具体的方法和工具。
The letter was written by hand. 这封信是用手写的（即不是打印的）。（by hand表示一种抽象的手段，是无形的，注意其中没用冠词或其他限定词)
I write with my hand, but he writes with his mouth. 我用手写字，但他却用嘴写字。（with one’s hand表示一种具体的工具，是有形的，注意其中用了物主代词)
二、in表示方式或手段主要有两个用法：
1、表示用某种语言。如：
What do you call this in English? / How do you say this in English? 这个东西用英语怎么说？
2、表示用某种材料。如：
Write your homework in ink, not in pencil. 用钢笔写家庭作业，不要用铅笔。